抑菌抗菌作用
 由于微波能直接抑制細菌的生長，同時也能抑制癌細胞的DNA和RNA的合成。 它還可以激活溶酶體并增加巨噬細胞和T細胞的吞噬能力。 這樣可以有效提高患者的免疫力，也可以達到很好的抗菌抑菌效果。  

抗炎作用
微波治療儀的微波輻射功率大小與其抗炎作用機制有直接關系，醫生需要根據具體情況進行操作，從而 確保良好的抗炎作用。 在低功率微波輻射下，炎癥也會逐漸消除，避免疾病的發展。  

對呼吸系統的影響 
一般的支氣管肺疾病，其實利用微波療法可以減慢呼吸，也可以增加支氣管通氣量。 特別是對于一些支氣管肺部非特異性炎癥患者，采用微波照射可以有效減輕炎癥，避免病情進一步加重。  

對神經系統的影響 
微波治療儀小功率、短時間的微波照射可直接增強大腦的興奮過程，而大功率、長時間的微波照射可增加抑制作用 影響。